La Universidad de Guayaquil se encuentra estructurada en Unidades Administrativas y Unidades Académicas. En las Unidades Administrativas tenemos la Administración Central y los Vicerrectorados, mientras que en las Unidades Académicas nos encontramos con 11 Facultades.

Unidades Académicas

Facultad de Arquitectura

Facultad de Ciencias Administrativas

Facultad de Ciencias Agrarias

Facultad de Ciencias Económicas

Facultad de Ciencias Matemáticas y Físicas

Facultad de Ciencias Médicas

Facultad de Ciencias Naturales

Facultad de Ciencias Psicológicas

Facultad de Ciencias Químicas

Facultad de Comunicación Social

Facultad de Educación Física, deportes y recreación

Facultad de Filosofía, Letras y Ciencias de la Educación

Facultad de Ingeniería Industrial

Facultad de Ingeniería Química